Bâtie sur le flanc d'une montagne, la ville de Canterlot est la capitale d'Equestria et se trouve d'ailleurs en son plein centre. La cité majestueuse, toute en verticalité, se constitue de hautes et élégantes tours d'ivoire, et est parcourue de nombreux jardins, de rivières et de cascades. La cité est habitée de beaucoup de licornes, qui constituent une majorité de l'aristocratie du pays, mais toutes les races de poneys y sont les bienvenues.

Si Ponyville apparait comme une charmante ville de campagne, plantée de maisons plus adorables les unes que les autres, cette ville est particulière par bien des aspects. Fondée par la famille Apple, c'est sans aucun doute l'une des villes les plus cosmopolites de tout Equestria, puisque l'on y retrouve autant de poneys terrestres que de pégases et de licornes. La ville est également suffisamment proche de Canterlot pour qu'on puisse y voir les hautes flèches du palais royal. Quelques heures de train suffisent généralement à faire le trajet. La ville est également remarquable par la présence de Sweet Apple Acres, connue pour sa production de pommes zap. On y trouve également la fameuse École de l'Amitié fondée par la princesse de l'amitié, Twillight Sparkle.

Voisine de Poneyville, l'Everfree Forest est un lieux réputé maudit à juste titre. Sauvage, indomptable et indomptée, on y trouve toute sorte de monstres, des Timberwolfs aux Ursa Majors. La traverser n'a rien d'une partie de plaisir.

Grande ville dans les nuages, Cloudsdale est exclusivement habitée par les Pégases, qui sont seuls capables de marcher sur les nuages. Ses bâtiments adoptent un style antique, tout en colonnes de marbre blanc, et ses rues sont parcourues de rivières arc-en-ciel qui tombent en cascade et arrosent les terres en dessous de cette cité mouvante. En effet, Cloudsdale se balade un peu partout en Equestria, apportant avec elle la pluie et le beau temps, puisque c'est aux Pégases qu'échoit la tâche de veiller au climat dans ce monde.

Equestria est piqué de nombreuses villes importantes, qui seront réunies ici pour plus de simplicité.

Appleloosa est une ville située au sud de l'everfree Forest, en plein territoire aride. Cela n'a pas empêché ses habitants de s'y installer et d'y créer des fermes de pommes. L'ordre y est maintenue par un shérif et son ambiance fait très Western, dans tous ses aspects. En effet, il n'est pas rare que les habitants entrent en conflit avec les Bisons qui vivent dans ces étendues désertiques, très proches de leurs traditions, qui ont vue d'un mauvais œil ces colons poneys s'installer sur leur territoire. Les tensions sont cependant apaisées aujourd'hui, et ces deux peuples semblent avoir trouvé un terrain d'entente.